一、增施肥料由于一年內在有限的面積上栽培多茬蔬菜，其產量又高，從土壤中吸收的養分較多，因此，比露地蔬菜栽培要求供應更多的肥料，才能滿足設施蔬菜生長發育的需求。應以增施有機肥為主，配合適量的氮、磷、鉀化肥。

二、補施二氧化碳棚室內二氧化碳的濃度在太陽出來后，隨著光合作用的進行而逐漸減少，以至不能滿足光合作用正常進行的需求，故人工補施二氧化碳增產效果明顯。

三、選擇適宜的肥料品種由于設施內比較密閉，單位面積上的施肥量又較高。

四、禁止使用易產生有害氣體的肥料如碳酸氫銨易分解產生氨氣，沒有腐熟的餅肥、雞糞、人糞尿等肥料，在設施內高溫條件下易分解產生大量氨氣。當棚室內氨氣濃度超過5毫克／千克時，蔬菜就會受害。